Проблема мировой важности...

[MadCat]

Есть много путей, но вот один из самых лучших для вырезания прямоугольных форм:
Слева на панели инструментов есть, Rectangular Marquee tool или просто буква M(на клавиатуре, латинскими).
С помощью него выделяешь нужную область. Делаешь Edit->Copy.
Всё теперь этот кусок в памяти, можно вставить в файл или в слой.
Файл создать просто File->new он создаст файл размером выделенной области. Потом Edit - > Paste.
Слой думаю тебе не нужен.